En 1937, avant le début de la Seconde Guerre mondiale, le lieutenant-colonel Yuuki de l'armée impériale japonaise forme l'« Agence D », une unité de renseignement de l'armée sous son commandement et sa tutelle. L'état-major général de l'armée attache le lieutenant Sakuma pour observer la performance de l'unité. D Agence jette un large filet pour trouver des agents au-delà du personnel militaire japonais, et Yuuki établit les principes de l'Agence D, qui vont à l'encontre de la doctrine de l'IJA : « Ne tuez pas, ne vous faites pas tuer, ne vous faites pas capturer. »

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