Le "Inazuma Legend Japan" qui a remporté le FFI un jour et le "New Inazuma Onze", qui a joué à travers le Holy Road Tournament ont un match d'exposition. Mais soudain beaucoup de petits objets apparaissent et commencent à attaquer le stade. Ce sont les petits robots "LBX", une technologie jamais vu auparavant dans ce monde. Tenma et ses amis essaient de répondre à l'attaque, mais les petits robots continuent à apparaître l'un après l'autre, jusqu'à ce que Yamano Ban semble les sauver. L'équipe de football la plus forte et l'armée la plus forte LBX sont maintenant unis, et une bataille féroce est sur le point de commencer!

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