Deux ans se sont écoulés depuis la fin du "Martian Successor Nadesico". Akito et Yurika ont disparu. Les Joviens et les Terriens ont uni leurs forces et Ruri est désormais le capitaine du Nadesico B. Alors que la popularité du saut en boson grandit, un vaste réseau de transport a été développé. Baptisé Plan Hisago, ce réseau de portails Chulip renferme les réponses aux mystères des particules de Bose et de leur pouvoir. Si ces secrets tombent entre de mauvaises mains, cela pourrait entraîner de graves problèmes. Et de gros ennuis, il y en a. Un groupe martien a lancé une offensive, laissant les Forces Unies désemparées et désespérées. À tel point que l'ancien équipage du Nadesico est rappelé au service actif pour une mission spéciale non autorisée : nous sauver tous. Cette ménagerie de marginaux a-t-elle ce qu'il faut ? Qui gagnera la course à la technologie du boson ? Et qu'est-il arrivé à Akito et Yurika ?

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