Dans un futur pas si lointain, une grande partie de la terre a été submergée par la mer ou détruite par des tremblements de terre. Au centre de la tourmente se trouve le mystérieux Orphelin. Orphan peut ou non être à l'origine des cataclysmes. Le but d'Orphan est de faire remonter à la surface un vaisseau caché dans les profondeurs de la mer, mais cela entraînerait la destruction de tous les humains, à l'exception d'un petit nombre d'entre eux qui lui sont fidèles.
Les agents d'Orphan pilotent de mystérieux mecha connus sous le nom de Grand Cheres, et parcourent le monde à la recherche de mystérieux disques géants qui apparaissent occasionnellement, volant à grande vitesse et détruisant une grande partie de la campagne, ou des villes, lorsqu'ils touchent le sol. Après qu'un disque mourant a failli tuer Hime, un Brain Powerd est né du disque. Les Brain Powerd sont un autre type de Mecha, similaire mais pas identique aux Grand Cheres.
Hime devient le pilote du Brain Powerd, formant une relation symbiotique avec le mecha vivant et rejoint une organisation internationale dédiée à l'arrêt d'Orphan, ou au moins à la sauvegarde de l'humanité si Orphan réussit à s'en sortir.

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