Takato Matsuda, Ruki Matsuno et Lee Jenrya sont des enfants qui ont reçu par hasard de vrais Digimon, contrairement aux Digimon imaginaires du jeu de cartes auquel ils jouent. Chacun des enfants, ou "dompteurs de Digimon", a sa propre opinion sur la façon dont les Digimon doivent être traités. Mais lorsque d'autres Digimon commencent à apparaître au Japon, ils doivent mettre de côté leurs différences pour repousser les intrus numériques, même si Yamaki, qui est à la tête d'une organisation secrète appelée Hypnos, essaie d'éliminer lui-même tous les Digimon.

(Source : Anime News Network)

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