Iwaki Tomonori est un garçon ordinaire de 15 ans qui aime les femmes plus âgées. Il a le béguin pour son professeur, mais apprend peu après qu'elle s'est fiancée. Il rentre chez lui le cœur brisé, pour y trouver une jeune fille de 12 ans nommée Rizel, avec laquelle il apprend que le gouvernement japonais l'a marié contre son gré. De plus, il apprend que Rizel n'est pas une fille ordinaire ; c'est une humaine issue de l'ingénierie biochimique, et ses créateurs (ses "papas", comme on les appelle souvent) promettent de renoncer à plusieurs factures des parents d'Iwaki en échange de l'autorisation de rester chez eux, et c'est ainsi que commence la vie d'Iwaki avec Rizel.

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